使用Python来简单处理TCGAbiolinks整理的表达矩阵以方便后续处理分析
Scanpy是一种可扩展的工具包,用于分析与Anndata共同构建的单细胞基因表达数据。它包括预处理,可视化,聚类,轨迹推理和差异表达测试。基于Python的实施有效地处理了超过一百万个单元的数据集。本文是学习Scanpy过程中的体会与记录。